Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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COL9A2Q14055 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
COL9A2Q14055 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
COL9A2Q14055 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
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