Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PTCH1Q13635 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PTCH1Q13635 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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