Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CBX3Q13185 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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