Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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CALCOCO2Q13137 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CALCOCO2Q13137 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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CALCOCO2Q13137 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CALCOCO2Q13137 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CALCOCO2Q13137 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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CALCOCO2Q13137 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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CALCOCO2Q13137 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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CALCOCO2Q13137 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CALCOCO2Q13137 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
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