Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
STRN3Q13033 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
STRN3Q13033 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms