Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PTPN13Q12923 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTPN13Q12923 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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