Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FAAP100Q0VG06 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FAAP100Q0VG06 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms