Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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