Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHRNDQ07001 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNDQ07001 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms