Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
GRIN1Q05586 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms