Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN12Q05209 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms