Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

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Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL20P78556 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCL20P78556 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCL20P78556 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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