Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA9P57773 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA9P57773 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA9P57773 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA9P57773 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJA9P57773 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJA9P57773 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJA9P57773 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms