Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PCBP4P57723 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms