Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SH3BGRP55822 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms