Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
LUMP51884 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LUMP51884 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LUMP51884 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LUMP51884 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
LUMP51884 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LUMP51884 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
LUMP51884 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
LUMP51884 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
LUMP51884 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms