Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CRIP1P50238 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms