Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PTGDSP41222 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms