Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LAMA1P25391 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LAMA1P25391 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms