Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PTAFRP25105 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms