Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SPI1P17947 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPI1P17947 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPI1P17947 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SPI1P17947 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SPI1P17947 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SPI1P17947 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms