Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB4P17483 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB4P17483 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms