Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HOXB3P14651 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms