Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CTSLP07711 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CTSLP07711 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms