Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SIN3BO75182 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SIN3BO75182 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms