Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 AC025040.1-201ENST00000560375 1284 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MSH5O43196 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MSH5O43196 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 LINC02147-202ENST00000509669 637 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 KRTAP4-3-201ENST00000391356 964 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AL024474.2-201ENST00000431309 501 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AC024267.5-201ENST00000579154 599 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MSH5O43196 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms