Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VGFO15240 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VGFO15240 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VGFO15240 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VGFO15240 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VGFO15240 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VGFO15240 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
VGFO15240 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VGFO15240 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VGFO15240 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VGFO15240 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VGFO15240 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VGFO15240 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VGFO15240 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
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