Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA5O15230 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA5O15230 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA5O15230 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA5O15230 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
LAMA5O15230 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LAMA5O15230 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms