Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ARPC1BO15143 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms