Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
COPEO14579 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COPEO14579 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COPEO14579 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPEO14579 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPEO14579 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPEO14579 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPEO14579 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPEO14579 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPEO14579 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPEO14579 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COPEO14579 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms