Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
E2F3O00716 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F3O00716 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F3O00716 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
E2F3O00716 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
E2F3O00716 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
E2F3O00716 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms