Protein–RNA interactions for Protein: E9PGA6

C1QTNF3-AMACR, C1QTNF3-AMACR readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1QTNF3-AMACRE9PGA6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms