Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
B4DGG1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
B4DGG1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
B4DGG1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
B4DGG1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms