Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
GOLGA6L9A6NEM1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms