Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ap3b1Q9Z1T1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Ap3b1Q9Z1T1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Ap3b1Q9Z1T1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Ap3b1Q9Z1T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Ap3b1Q9Z1T1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms