Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS7AQ9UBW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS7AQ9UBW8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS7AQ9UBW8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS7AQ9UBW8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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