Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prkab1Q9R078 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prkab1Q9R078 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prkab1Q9R078 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prkab1Q9R078 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Prkab1Q9R078 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms