Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR7

Acot3, Acyl-coenzyme A thioesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acot3Q9QYR7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Acot3Q9QYR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Acot3Q9QYR7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Acot3Q9QYR7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Acot3Q9QYR7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Acot3Q9QYR7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Acot3Q9QYR7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms