Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psma6Q9QUM9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psma6Q9QUM9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Psma6Q9QUM9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms