Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FancaQ9JL70 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FancaQ9JL70 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FancaQ9JL70 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FancaQ9JL70 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
FancaQ9JL70 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
FancaQ9JL70 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
FancaQ9JL70 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
FancaQ9JL70 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1162.8 ms