Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NBPF3Q9H094 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NBPF3Q9H094 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NBPF3Q9H094 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NBPF3Q9H094 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms