Protein–RNA interactions for Protein: Q9D924

Isca1, Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isca1Q9D924 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Isca1Q9D924 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Isca1Q9D924 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Isca1Q9D924 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Isca1Q9D924 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Isca1Q9D924 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Isca1Q9D924 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms