Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AplfQ9D842 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
AplfQ9D842 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
AplfQ9D842 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
AplfQ9D842 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms