Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl35Q9CQL6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl35Q9CQL6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mrpl35Q9CQL6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Mrpl35Q9CQL6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Mrpl35Q9CQL6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Mrpl35Q9CQL6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Mrpl35Q9CQL6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl35Q9CQL6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl35Q9CQL6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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