Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ77

1700129C05Rik, 1700129C05Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700129C05RikQ9CQ77 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700129C05RikQ9CQ77 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700129C05RikQ9CQ77 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700129C05RikQ9CQ77 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
1700129C05RikQ9CQ77 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700129C05RikQ9CQ77 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
1700129C05RikQ9CQ77 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
1700129C05RikQ9CQ77 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
1700129C05RikQ9CQ77 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
1700129C05RikQ9CQ77 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
1700129C05RikQ9CQ77 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
1700129C05RikQ9CQ77 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
1700129C05RikQ9CQ77 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms