Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Efcab2Q9CQ46 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Efcab2Q9CQ46 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Efcab2Q9CQ46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Efcab2Q9CQ46 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Efcab2Q9CQ46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Efcab2Q9CQ46 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms