Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SH2D3AQ9BRG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH2D3AQ9BRG2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SH2D3AQ9BRG2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH2D3AQ9BRG2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH2D3AQ9BRG2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms