Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MCCC1Q96RQ3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCCC1Q96RQ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCCC1Q96RQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCCC1Q96RQ3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms