Protein–RNA interactions for Protein: Q96A23

CPNE4, Copine-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE4Q96A23 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CPNE4Q96A23 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CPNE4Q96A23 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CPNE4Q96A23 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CPNE4Q96A23 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms