Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Cts3Q91ZD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cts3Q91ZD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cts3Q91ZD5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cts3Q91ZD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cts3Q91ZD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cts3Q91ZD5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms